喷油器是柴油机的关键部件，其工作的好坏直接影响柴油机的动力性、经济性、排放、可靠性。根据混合气形成和燃烧的要求，喷油器应具有一定的喷射压力、喷射行程、合适的喷油锥角，此外喷油器在需停止喷油时应能迅速切断燃油供给，不发生滴油现象。
共轨系统零部件对燃油系统中的水比较敏感，尤其是喷油器这种带有精密阀组件的零件，其本身是靠的柴油润滑的。一旦系统进入水份可能会造成部件锈蚀或润滑不良等问题。其中常见的喷油器故障主要有：
喷油器雾化不良
故障现象：柴油机功率下降，排气冒黑烟，机器运转声也不正常。
故障分析：当喷油压力过低，喷孔磨损有积碳、弹簧端面磨损或弹力下降时，都会致使喷油器提前开启，延迟关闭，并形成喷油雾化不良现象。另外，由于粒径过大的柴油雾滴不能充分燃烧，便顺着缸壁流入积油盘，使机油油面增高，粘度下降，润滑恶化，还可能引起烧瓦拉缸的事故。
针阀卡死
故障现象：发动机功率下降，抖动，严重的甚至无法启动。
故障分析：柴油中的水分或酸性物质会使针阀锈蚀而被卡住，针阀密封锥面受损后，缸内可燃气体也会窜入配合面形成积碳，使针阀咬死，喷油器便失去喷油作用，致使该缸停止工作。
针阀与针阀孔导向面磨损
故障现象：功率降低，发动机启动困难，甚至无法启动。
故障分析：针阀在针阀孔内频繁地往复运动，加之柴油中杂质污染的侵入，会使针阀孔导向面逐渐磨损，因而间隙增大或出现拉伤刻痕，导致喷油器内漏增加，压力降低，喷油量减少，喷油时间滞后，造成柴油机起动困难。当喷油时间延迟过多时，柴油机甚至不能运行，此时应更换针阀偶件。
喷油嘴滴油
故障现象：当柴油机温度低时，启动困难，排气管冒白烟，柴油机温度上升后则变成黑烟。且油耗高。
故障分析：当喷油器工作时，针阀体的密封锥面会受到针阀频繁的强力冲击，再加上高压燃油不断地从该处喷射出，锥面会逐渐出现磨损或斑点，从而造成喷油器滴油。当柴油机温度低时，排气管冒白烟，柴油机温度上升后则变成黑烟。检查针阀的运动是否灵活，锥面应无磨损且密封性否则就需要更换新的喷油嘴偶件。
回油量过高
故障现象：使喷油压力降低，喷油时间推迟，发动机功率下降，甚至造成柴油机熄火。
故障分析：当针阀偶件磨损严重或针阀体与喷油器壳配合不够严密时，喷油器的回油量就明显增大，同时还需要注意的是阀板，这个一旦磨损也会导致喷油器回油量过大，影响发动机性能。
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